Die Forschungsgruppe Molekulare Mikrobiologie in der Siedliungswasserwirtschaft unter der Leitung von Julia Vierheilig weist eine lange Tradition in der Wasser- und Abwassermikrobiologie auf und beschäftigt sich neben der Quantifizierung mikrobiologischer und chemischer Stoffumsatzprozesse in der Abwasserreinigung und im Gewässer mit der Identifizierung und Behebung von biologischen Problemen bei der industriellen und kommunalen Abwasserreinigung.

Einen großen Stellenwert nehmen derzeit abwasserepidemiologische Untersuchungen im Zusammenhang mit Sars-CoV-2 ein.